莱茵衣藻碳酸酐酶基因家族的生物信息学分析

MA Yan-bo, DENG Bi-cheng,HOU Yu-yong,LU Si-han,GUO Zhi-le,WANG Wei-jie

Journal of Hebei United university natural sclence edition(2023)

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Abstract
利用生物信息学的方法在莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的全基因组中,鉴定出 8 个碳酸酐酶(Carbonic Anhydrase,CA)家族基因,分别在理化性质、同源性、保守基序和染色体定位等方面分析,并对莱茵衣藻培养过程中添加碳酸氢盐实验和相关基因的表达进行分析.结果显示:8 个莱茵衣藻 CA 蛋白序列长度为 264~399 aa,分子量为 33.46~42.17 kDa,理论等电点pI介于 5.7~9.05 之间;莱茵衣藻CA基因家族分为 3 个亚族;莱茵衣藻的 8个CA基因均含有特定保守基序;染色体定位发现基因 Cr1 和 Cr2 在 4 号染色体,Cr4 和 Cr5在 5 号染色体,Cr3 和Cr6 在 9 号染色体,Cr7 和Cr8 分别在 12 和 13 号染色体上;添加碳酸氢盐的实验和相对表达分析表明CA基因在利用无机碳发挥着重要的作用.
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