CCL20通过IL-17信号通路调控糖尿病肾病炎症进展

Dong Lan, Zhao Sheng, Li Wenchuan,Li Yuejiao, Lian Rong,He Feng

New Medicine(2023)

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Abstract
目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别糖尿病肾病(DN)外周血中的关键基因,探讨DN的发病机制,为其发生、发展提供新的见解.方法 通过基因表达总库(GEO)下载数据集GSE142153 进行差异表达基因(DEGs)筛选,应用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析DEGs参与的分子生物学过程.通过构建WGCNA识别关键模块和中枢(hub)基因,应用验证集GSE65561 分析受试者操作特征曲线从而验证hub基因潜在的临床诊断价值;随后采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测hub基因在DN患者外周血中的相对表达量.结果 数据集GSE142153 包含 23 例DN患者、10 例健康对照者.根据筛选标准,DN组有 181 个DEGs,其中 106 个基因表达上调和 75 个基因表达下调.KEGG富集分析聚焦于IL-17、核因子-κB、酪氨酸蛋白激酶/信号转导及转录激活因子等炎症通路激活.WGCNA识别了 16 个模块,其中,turquoise模块被认为对DN最具临床意义,选择turquoise模块中的基因与DEGs、IL-17 信号通路基因相交得C-C趋化因子配体 20(CCL20)、IL-1β、C-X-C趋化因子配体1、基质金属蛋白酶-9、FOS样抗原 1 基因.临床DN患者外周血RT-qPCR验证,结果与生物信息学分析一致.结论 CCL20 等hub 基因可能通过调控IL-17 信号通路促进DN的炎症发展,该类基因有助于确定DN的潜在生物标志物和治疗靶点.
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