基于自噬长链非编码RNA调控网络识别胰腺导管腺癌生物分子标记和靶向药物

目的 利用公共转录组RNA测序数据系统性地探索与胰腺导管腺癌(PDAC)预后相关的自噬长链非编码RNA(lncRNA)及潜在的治疗药物.方法 从TCGA数据库中获取PDAC患者转录组数据(RNA-seq)及临床数据.采用Pearson相关分析确定与自噬基因表达相关的lncRNAs(ARlncRNA).利用单因素Kaplan-Meier法和多因素Cox回归分析筛选重要的与PDAC患者预后相关的ARlncRNA,构建受ARlncRNA调控的基因网络识别核心基因.最后,借助蛋白质互作网络和药物-基因相互作用数据库(DGIdbs)识别分子靶向药物.结果 筛选出12个ARlncRNA与PDAC患者预后相关,10个共表达mRNA(核心基因)对患者总生存期有显著影响.富集分析主要为自噬通路.网络分析和数据库挖掘发现了 3个PDAC潜在治疗药物(阿法替尼、达克替尼和奥希替尼).结论 建立ARlncRNA-mRNA网络以期揭示PDAC的发病机制和识别分子标记,经DGIdbs识别3个PDAC潜在治疗药物.