Pathologie infectieuse du tube digestif : diagnostics à ne pas manquer

Le contexte récent du COVID-19 a renouvelé l’intérêt des pathologistes pour les maladies d’origine infectieuse. Cet intérêt est d’autant plus fort dans le tube digestif où les symptômes sont aspécifiques, souvent frustres avec un aspect endoscopique normal entraînant parfois une errance diagnostique. Dans ce contexte, les biopsies systématiques réalisées par le clinicien sont parfois le seul moyen de parvenir au diagnostic. Néanmoins, le diagnostic précis de ses pathologies nécessite une bonne connaissance à la fois du contexte de survenue de ces pathologies, de l’aspect histopathologique et d’une analyse rigoureuse utilisant des colorations spéciales et/ou des analyses immunohistochimiques. Certaines pathologies infectieuses du tube digestif sont bien connues par les pathologistes qui sont largement sollicités dans leurs diagnostics (gastrite à Helicobacter pylori, œsophagite à Candida albicans ou la colite à CMV), mais d’autres sont plus délicates à diagnostiquer. Dans cet article, nous présenterons, après avoir rappelé les différentes colorations spéciales utiles, des pathologies bactériennes ou parasitaires rares ou de diagnostic difficile « à ne pas manquer » dans le tube digestif.