奶牛隐性乳房炎抗性相关基因多态性与体细胞评分关联分析

为了探讨中国荷斯坦奶牛隐性乳房炎相关基因NOD2c.4500、CXCR1+777、SPP1-1301、TLR4+2021、CXCR2+777、BRCA1c.46126单核苷酸多态性(SNPs)位点与体细胞评分的关联性,试验利用PCR-SSCP及Sanger测序技术对135头中国荷斯坦奶牛的6个SNPs位点进行基因分型,分析SNPs位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分的相关性,并运用多座位外显方差分析法(MPVA)对不同多基因聚合与奶牛体细胞数的相关性进行研究.结果表明:在6个SNPs位点上均检测到碱基突变,在NOD2c.4500 C＞A、CXCR1+777 G＞C、SPP1-1301 G＞A、TLR4+2021 C＞T 位点、上均检测到 3 种基因型,其中优势基因型分别为CA、CC、AA、CC,优势等位基因分别为 A、G、A、C.在CXCR2+777 G＞C、BRCA1c.46126 G＞T位点上均检测到2种基因型,其中优势基因型均为GG,优势等位基因均为G.SPP1-1301 G＞A、TLR4+2021 C＞T位点均处于低度多态(PIC＜0.25),其余位点则均处于中度多态(0.25＜PIC＜0.5);6 个 SNPs 位点均处于 Hardy-Weinberg 平衡状态(P＞0.05).CXCR2+777 G＞C、TLR4+2021 C＞T位点与体细胞评分的关联未达到显著差异(P＞0.05);NOD2c.4500 C＞A位点CA基因型、CXCR1+777 G＞C 位点 CC 基因型、SPP1-1301 G＞A 位点 AA 基因型、BRCA1c.46126 G＞T 位点GT基因型个体的体细胞评分显著低于其他基因型个体(P＜0.05).SPP1-1301-CXCR1+777-NOD2 c.4500为多基因聚合分析中最佳多座位组合,SPP1(AA)-CXCR1(CC)-NOD2(CA)为最佳基因型组合.说明SPP1-1301、CXCR1+777、NOD2c.4500位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分显著相关,可作为奶牛隐性乳房炎抗性基因的分子辅助标记.