基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析
Acta Phytophylacica Sinica（2021）
摘要
为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析.结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2％;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中有性生殖后期表达的基因数最多,达15221个;无性产孢和侵染小麦穗过程中基因表达水平整体较高,而分生孢子中基因表达水平最低.在燕麦培养基上禾谷镰刀菌气生菌丝的基因表达模式与侵染过程中的基因表达模式较为相似,而与营养生长菌丝的基因表达模式差异较大.该菌次生代谢物合成特征酶基因和分泌蛋白基因的表达模式均分成3类,即分别在侵染、营养生长和有性生殖过程上调表达,暗示其在生活史不同阶段的特异性功能.
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