基于线粒体CO Ⅰ基因的9个青鱼群体遗传变异分析

为掌握中国青鱼(Mylopharyngodon piceus)种质资源分布特征,揭示青鱼种质资源的遗传变异情况,研究通过对9个青鱼群体271个样本线粒体CO Ⅰ区设计引物并进行PCR扩增,运用软件分析了群体内部遗传多样性和各群体之间的进化关系.分析结果表明:长度为1003 bp的9个群体CO Ⅰ基因区域序列GC含量低于AT含量,共检测到6个突变位点,7种单倍型,其中Hap4单倍型在9个群体中都有分布.AMOVA分子方差分析显示271个青鱼样本的变异90.33％来自群体内部,9.67％来自群体间.青鱼总体核苷酸多样性(π)偏低,在0.00109-0.00244.单倍型多样(Hd)性较高,在0.403-0.847.遗传分化系数(Fst)在-0.0033-0.23445,保持在低度至高度分化,主要集中在低度和中度分化.分析得到广东佛山群体可能经历过瓶颈效应,其余8个群体可能经历过快速的种群扩张事件.研究结果揭示了中国目前青鱼种质资源的遗传背景,可以为中国青鱼种质资源的保护和创新利用提供重要的参考依据.