免疫抑制大鼠肺部菌群分析

目的 通过环磷酰胺注射建立免疫抑制大鼠模型,探究免疫抑制大鼠肺部菌群变化,为探究免疫低下患者肺部感染菌群的结构与来源提供依据.方法 选用140～160 g雄性SD大鼠,随机分为对照组(A)和免疫抑制组(B),每组10只.每日按60 mg/kg体质量给予免疫抑制组大鼠腹腔注射浓度为10 mg/ml环磷酰胺溶液,对照组大鼠仅腹腔注射等体积生理盐水溶剂.连续注射3 d后,分别对两组大鼠心脏采血,测血细胞计数,取肺组织进行16s rDNA高通量测序和生物信息学分析.结果 与A组相比,B组大鼠中性粒细胞、淋巴细胞、单核细胞等白细胞数量明显降低.A组各门水平上优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线杆菌门(Actinobacteria);在属水平上优势菌属为乳酸杆菌(Lactobacillus)、拟杆菌(Bacteroides)以及未定型瘤胃球菌(unidentified_Ruminococcaceae)等.B组在门和属水平上与A组无明显差异.对样本进行Alpha多样性指数组间差异分析,ACE、Chao1、Shannon、Simpson四个指数间差异不显著(pACE=0.569,pChao1=0.599,pShannon=0.370,pSimpson=0.460).PCoA分析结果表明,两组各样品分布相似度较高.结论 通过高剂量环磷酰胺腹腔注射,成功制作免疫抑制大鼠模型.阐明免疫抑制大鼠和正常大鼠肺部菌群结构,并发现两者在丰度和多样性上差异并不显著.这提示,免疫低下患者肺部感染的致病菌可能并非源自肺部机会致病菌的异常增殖,而是来源于外界环境吸入.