基于DNA条形码鉴定口岸截获鼠类

Chinese Journal of Frontier Health and Quarantine(2022)

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摘要
目的 利用基于线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(COI)基因、线粒体控制区(D-loop)基因、16S rRNA基因的DNA条形码技术对广州口岸截获的1只死鼠进行种类鉴定.方法 从鼠肌肉中提取DNA,用PCR法扩增COI、D-loop、16S rRNA基因片段,将测序结果与GenBank和BOLD systems v4中鼠类的DNA条形码进行比对,用Mega 6.0构建系统发育树,计算遗传距离.结果 该鼠类样本能扩增出COI、D-loop、16S rRNA基因片段,通过COI、16S rRNA基因扩增片段序列比对与德氏柔毛鼠Praomys daltoni同源性均为99%,D-loop基因扩增片段序列比对与猪吻柔毛鼠Praomys rostratus同源性为100%,结合形态学特征,最终鉴定为德氏柔毛鼠Praomys daltoni.结论 COI、16S rRNA基因片段能够对鼠类进行有效鉴定,弥补了形态学鉴定的不足之处.
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