肾纤维化中心基因的鉴定

目的 肾纤维化(renal?fibrosis,?RF)是指引起肾脏细胞外基质异常沉积并取代正常肾脏结构的病理生理变化,是慢性肾脏病(chronic?kidney?disease,CKD)发展到终末期肾病(end?stage renal?disease,ESRD)的唯一途径.RF的防治是遏制CKD进展的关键,也是肾脏疾病研究的热点和难点.因此,确定与RF相关的中心基因对于开发防治RF的新策略至关重要.方法 分析了两个数据库(GSE35257和GSE121190)肾脏组织的基因表达特征,并利用GEO2R工具获得差异表达基因(differential?expression?genes,DEGs).然后,使用DAVID数据库进行GO分析以及KEGG富集分析.随后,我们使用STRING数据库并构建了PPI网络,最后使用Cytoscape软件的cytoHubba插件来选择中心基因.结果 从GSE35257数据库中筛选了930个DEGs,包括504个上调DEGs和426个下调DEG;从GSE121190数据库中过滤了2053个DEGs,包括898个上调DEGs和1155个下调DEGs.功能富集分析表明,DEGs涉及许多功能和表达途径,如细胞外泌体、对药物反应、NAD或NADP作为受体、核系统、发育、蛋白激酶结合等途径.它由97个节点(蛋白质)和404个PPI边缘(相互作用)构建的PPI网络中得到证明.最后得到GAPDH、CCND1、ACTA2、MTOR、ABL1、ANK3、CXCL12、PRRX1、CTSB、MAP2K7在内的十个基因被确定为RF相关的中心基因的新候选者.结论 研究的结果提示RF的发病机制和潜在的新治疗靶点提供了全面的见解.