牦牛GEM基因克隆及生物信息学分析

旨在获得美仁牦牛GEM基因CDS区序列,并通过生物信息学分析了解其生物学特征和结构.选取7日 龄健康美仁牦牛公犊牛,屠宰后收集其心肌组织,并提取心肌组织总RNA,运用RT-PCR技术克隆美仁牦牛GEM基因序列.结果表明,获得美仁牦牛GEM基因序列1 478 bp(登录号:XM_005895531.1),其中,CDS区长936 bp,5'UTR 67 bp和3'UTR 475 bp,共有12个开放阅读框,编码311个氨基酸;美仁牦牛GEM蛋白质理论等电点9.72,不稳定指数56.42,半衰期30 h,总平均亲水性-0.565,为不稳定碱性亲水性蛋白;美仁牦牛GEM属于非分泌蛋白且无信号肽,不具有跨膜结构域,拥有29处磷酸化修饰位点;通过亚细胞定位发现,GEM蛋白主要存在于细胞核内.