潜在马铃薯晚疫病抗性基因的表达和SNP标记分析
Journal of Anhui Agricultural Sciences（2023）
Abstract
从马铃薯参考基因组中筛选出了433个NBS-LRR类基因,并绘制这些基因在基因组中的分布图,这些基因的其中一部分成簇分布.马铃薯基因组测序协会(PGSC)的转录组数据分析显示,只有 12 个NBS-LRR类基因在PGSC的转录组数据中完全没有检测到表达,不同NBS-LRR类基因转录水平不同,一部分NBS-LRR类基因有较高的生物胁迫和激素刺激应激性.分析了这 433 个基因的编码区域的单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP标记作为在高通量测序和生物大数据分析中最常使用的遗传标记,有助于鉴定NBS-LRR基因在不同马铃薯品种中的实际抗病性.
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