唐古拉山牦牛群体的母系遗传多样性及遗传结构分析

[目的]旨在从分子水平上揭示并探究青海省唐古拉山牦牛群体的母系遗传多样性、群体结构及遗传背景.[方法]对 52 头唐古拉山牦牛个体mtDNA D-loop 区序列进行PCR扩增、测序后,再进行序列比对分析并使用生物信息学软件确定其核苷酸变异位点和单倍型数目,计算单倍型多样度和核苷酸多样度值大小,并进行系统发育分析.[结果]在619 bp唐古拉山牦牛D-loop区序列分析中,排除2 处插入(缺失)后,共检测到31 个多态位点,其中包括5 个单一多态位点和 26 个简约信息位点.根据序列间核苷酸变异共确定了13 种单倍型,核苷酸多样度和单倍型多样度分别为0.007±0.004 和0.821±0.043.唐古拉山牦牛与我国其他18 个家牦牛品种和野牦牛相比,唐古拉山牦牛群体核苷酸多样度和单倍型多样度值均较低,表明该群体遗传变异较为贫乏且母系遗传多样性水平较低.以美洲野牛为外群,邻接法(即NJ法)构建的系统发育树结果显示:唐古拉山牦牛群体 13 种单倍型分布在A、B、C、D和E 5 种单倍型组中,且聚为2 个大的母系分支(即Ⅰ和Ⅱ),支系Ⅰ占比为77％,提示唐古拉山牦牛由 2 个母系支系组成,拥有 2 个母系起源且以支系Ⅰ为主.[结论]唐古拉山牦牛母系遗传多样性水平较低,由2 个母系支系组成,以支系Ⅰ为主,推测其有2 个母系起源.