广东佛山地区鸭圆环病毒分子流行株遗传变异分析

目的 研究广东佛山地区鸭圆环病毒(DuCV)流行毒株的遗传变异情况.方法 采用常规PCR方法,对采自广东佛山的3 份阳性鸭组织样品中扩增Rep基因部分片段和Cap基因,进行核苷酸序列测序,并将Rep基因部分片段、Cap基因推导的氨基酸序列与30 株参考序列进行同源性比较和遗传变化分析.结果 3 份阳性样品分别扩增出相应的基因片段;Rep基因部分片段、Cap基因推导的氨基酸序列进化树和同源性分析显示,3 株DuCV流行株与台湾株(AY3947213)在同一进化支,均属于DuCV-2 型,与同分支的参考毒株相似性分别为97.2％～100％和96.9％～100％,2 个基因型中 Rep 基因同源性高于 Cap 基因;氨基酸序列的变异分析表明,与中国台湾株(AY3947213)相比较,Rep部分氨基酸和Cap氨基酸分别发生相同位置的氨基酸置换和单独突变,Cap氨基酸突变位点多于Rep氨基酸.结论 研究测得的3 株DuCV流行株均属于DuCV-2 型,在广东地区有一定范围的流行,且CAP蛋白的变异程度高于REP蛋白,为鸭圆环病毒感染的监控和诊断提供了依据.