上海地区猪萨佩罗病毒的检测及遗传进化分析

为了明确猪萨佩罗病毒在仔猪腹泻病情中的作用,2016-2020 年采集上海市及周边 11 个猪场腹泻病料,共计1446 份.利用RT-PCR方法对其进行PSV筛检,并对阳性样品进行病原分离及病毒特性研究.结果显示:共筛检出256 份PSV核酸阳性样品,阳性率17.7％.从阳性样品中成功分离到2 株PSV病毒,全基因序列遗传进化分析显示2 株PSV分离株聚集在中国PSV毒株集群上,分离株在3D区域4696-5945 bp处存在重组区域.病毒核苷酸分析发现中国PSV毒株与韩国PSV毒株核苷酸相似性为 87％—88.5％,与欧洲PSV毒株核苷酸相似性为84.9％—87.3％.对VP1 基因氨基酸序列分析发现分离株与参考株存在氨基酸位点突变,中间氨基酸序列保守,无突变及插入和缺少现象.PSV分离株与参考株均含有173 位潜在糖基化位点,VP1 蛋白分子表面抗原表位分布均匀.该研究可为猪萨佩罗病毒病原学及其疫苗的研制奠定基础.