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南海岛礁海域金带齿颌鲷鳃组织和肠道菌群结构及其肠道菌群对碳源的利用特征

Journal of Fishery Sciences of China(2022)

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Abstract
为比较南海岛礁海域金带齿颌鲷(Gnathodentex aurolineatus)鳃组织和肠道菌群结构及其肠道菌群对碳源的利用特征,从南海3个岛礁海域采集优势岛礁鱼类——金带齿颌鲷的鳃组织和肠道样品,采用高通量测序技术分析其细菌群落结构组成,利用Biolog Eco微板法分析可培养肠道微生物的碳代谢功能.结果显示,各海域金带齿颌鲷鳃组织和肠道样品微生物菌群存在较高相似性,但门和属水平相对丰度存在显著差异.所有样品共有可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数为151个,其中永暑礁肠道样品的OTU数高达1022个,琛航岛肠道样品OTU数仅492个;门水平上,鳃组织和肠道样品共有的优势菌均为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes),特有的优势菌为放线菌门(Actinobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria);属水平上,鳃组织共有优势属为埃希氏-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、拟杆菌属(Bacteroide)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、发光杆菌属(Photobacterium)、Marispirillum 属、Pandoraea属;肠道样品中共有优势属为埃希氏-志贺氏菌属和拟杆菌属,其他优势属存在显著差异.肠道菌群的代谢活性和对氨基酸、糖类、脂类3类碳源的利用率由高到低均为渚碧礁组(ZB)、永暑礁组(YS)、琛航岛组(CH),3组间差异显著(P<0.05);功能预测结果显示代谢类相关功能基因所占比例高,对3类碳源的利用与可培养菌群碳源利用规律一致.研究表明,金带齿颌鲷肠道微生物菌群具有较高的碳源代谢能力,后续可尝试从肠道微生物中挖掘高产酶菌株.
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