基于R语言和PLINK程序的遗传性疾病的遗传位点分析

LI Peng, LIU Xi-wang, ZHANG Shuang-fei, ZHAO Fang,LUO Wen-zhi

Mathematics in Practice and Theory(2021)

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摘要
目前发现很多疾病与遗传相关,而遗传性疾病的遗传位点分析尚未得到有效的研究方法.现以1000个样本为例,首先利用R语言将基因位点进行二进制和十进制编码,然后用概率统计的方法和R语言对数据进行预处理,接着利用PLINK程序对样本进行数据分析,结合R语言得到较为清晰的Manhattan图及Cytoscape网络可视化模型.首次结合R语言和PLINK程序对遗传性疾病的遗传位点分析,能提高整个数据分析的速度,减少数据分析的成本,为解决遗传性疾病的遗传位点分析提供技术支持.同时此模型可以更方便地应用于实际生活中.
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