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基于网络药理学及分子对接技术分析远志治疗原发性失眠作用机制

Journal of New Chinese Medicine(2022)

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Abstract
目的:基于网络药理学及分子对接技术分析远志治疗原发性失眠(PI)的作用机制.方法:通过Herb、Batman-TCM数据库筛选远志的化合物,用Swiss Target Prediction、SEA及Batman-TCM数据库行主要活性成分潜在靶点筛选,同时在Gene Cards、NCBI基因、TTD数据库筛选疾病相关靶点.将远志的主要活性成分靶点与疾病靶点输入Venny2.1行交集处理,筛选两者的共同靶点,运用Cytoscape3.8.0软件构建"药物-成分-疾病-靶点"PPI网络并行拓扑分析.使用RStudio4.0.3软件行基因本体(GO)功能富集与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用Discovery Studio软件将远志主要活性成分与疾病核心靶点进行分子对接.结果:筛选出远志中含有金丝桃苷、α-菠甾醇、芦丁、槲皮素等9种主要活性成分,261个药物潜在作用靶点,与2 600个PI相关疾病靶点取交集后获得87个共有靶点.拓扑分析筛选到白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、人环磷酸腺苷反应元件结合蛋白1(CREB1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等36个关键靶点.GO功能富集分析得到BP条目1 302项、MF相关条目101项、CC相关条目63项;KEGG通路富集分析筛选到神经活性配体-受体相互作用、γ-氨基丁酸(GABA)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶-B(PI3K-Akt)、环磷酸腺苷(cAMP)、TNF等79条信号通路;分子对接显示远志主要活性成分与疾病核心靶点亲和力均良好.结论:远志能够通过多成分、多靶点、多通路的协同作用影响机体的神经代谢、氧化应激及炎症反应,从而发挥治疗PI的作用.
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