STAT3、STAT5A、RUNDC3B候选基因多态性与西藏世居人群高原红细胞增多症的易感性

Chinese high altitude medicine and biology(2021)

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摘要
目的 探讨STAT3、STAT5A、RUNDC3B候选基因多态性与西藏世居人群高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)易感性的相关关系.方法 采取病例对照研究策略,共招募567例HAPC患者和360例健康对照者.利用Illumina平台对STAT3、STAT5A和RUNDC3B基因进行目标区域靶向测序,并采用SPSS v26.0软件进行哈-温平衡(Hardy-Weinberg equilibri-um,HWE)分析,采用Plink v 2.0软件进行遗传模型分析,采用Haploview v 4.2软件进行连锁不平衡及单倍型分析,以及基因型-组织表达数据库(Genotype-Tissue Expression,GTEx)分析.结果 最终得到11个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点信息,其中有7个SNPs位点位于3'端非翻译区(3'-UTR),2个SNPs位点位于内含子(intronic)区域,1个SNP位点位于外显子(exonic)区域,1个SNP位点位于剪接(splicing)区域,STAT5A基因上的rs1135669位点为同义SNP.通过遗传模型分析发现,STAT3基因上的rs2293152位点的"GG"基因型在隐性模型下能降低HAPC的患病风险(OR=0.67,95% CI=0.46-0.97,P=0.035),而其他位点的基因型与HAPC的患病风险无关.各基因内的SNPs分别构成了各自的单倍型域,经单倍型分析未发现显著性差异.性别分层后的分析未发现与HAPC易感性相关的具有统计学意义的SNP位点.在本次研究中没有发现STAT5A和RUNDC3B基因有显著差异的SNP位点.结论 STAT3基因rs2293152位点可能参与西藏世居高原人群HAPC发生过程,作为保护因素起到一定的遏制作用.
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