紫花苜蓿MsGT6的生物信息学及其逆境胁迫下表达分析
Molecular Plant Breeding（2020）
Abstract
GT6基因属于Trihelix转录因子家族,该家族在调节植物生长发育及应答逆境胁迫等方面发挥着重要作用.为了明确紫花苜蓿Trihelix家族成员的基本特征及其在逆境胁迫下的响应,本研究利用生物信息学方法从蒺藜苜蓿数据库中鉴定出41个Trihelix成员,并对其进行染色体定位、系统进化树和保守基序分析.结果表明,Trihelix家族成员不均匀分布在8条染色体上,其中MtGT6定位在1号染色体上,其分子量为64.373 kD,等电点为5.895,属于亲水性蛋白;亚细胞定位预测显示该基因位于细胞核;对MtGT6启动子顺式作用元件分析,发现启动子区域存在多种顺式作用元件,推测其能在多种逆境中响应;qRT-PCR分析表明,该基因对盐碱响应更为明显.
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