感染严重发热伴血小板减少综合征病毒半饱血长角血蜱中肠微生物多样性分析

China Tropical Medicine(2023)

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摘要
目的 探讨携带严重发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)半饱血长角血蜱中肠微生物群落组成及多样性.方法 提取3组携带SFTSV半饱血长角血蜱中肠DNA,应用HiSeq平台对样品16S rDNA基因进行高通量测序,以操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)聚类分析、Alpha多样性分析阐明内共生微生物群落组成及多样性.结果 3组携带SFTSV半饱血长角血蜱中肠微生物聚类分别为143、113、163个OTU,绘制稀疏性曲线和丰度等级曲线,表明数据具有足够的测序深度,感染SFTSV半饱血长角血蜱中肠微生物组成丰富,但物种分布不均匀;微生物群落组成分析显示,在门水平上,变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)为主要优势菌门.在纲水平上,γ-变形杆菌纲(Gammaproteobacteria)、杆菌纲(Bacilli)、β-变形杆菌纲(Betaproteobacteria)、放线菌纲(Actinomycetia)为主要优势菌纲.在目水平上,军团菌目(Legio-nellales)、芽孢杆菌目(Bacillales)、伯克氏菌目(Burkholderiales)、放线菌目(Actinomycetales)为主要优势菌目.在科水平上,柯氏体科(Coxiellaceae)、杆菌科(Bacillaceae)、莫拉菌科(Moraxellaceae)、红藻科(Rhodocyclaceae)为主要优势菌科.在属水平上,以柯氏体属(Coxiella)相对丰度最高,其次主要为苍白空气芽孢杆菌属(Aeribacillus)、Azonexus;Alpha多样性分析结果显示,Shannon指数平均值为139.67,Simpson指数平均值为0.48,Chao指数平均值为145.06,ACE指数平均值为147.11.结论 感染SFTSV半饱血长角血蜱中肠微生物物种多样性丰富.研究结果为进一步探讨长角血蜱肠道微生物与SFTSV互作关系以及开发对蜱虫与蜱传疾病防治的新思路提供了依据.
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关键词
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,Haemaphysalis longicornis,16S rDNA,high throughput sequencing,analysis of intestinal microbial diversity
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