基于全基因组重测序对7个牦牛类群的群体结构分析

为了探究美仁牦牛遗传资源的进化历史和群体结构,以分布于甘肃省甘南藏族自治州合作市的美仁牦牛及周边分布的 7 个牦牛群体为研究对象,基于全基因组重测序技术,结合主成分分析、系统进化树、杂合度分析、群体连锁不平衡分析和群体分化指数等研究其群体进化情况.结果表明,7 个牦牛群体间均表现为较高的分化程度;美仁牦牛单独聚为一类,甘南牦牛、雪多牦牛和帕米尔牦牛聚为一类,天祝牦牛、木里牦牛及九龙牦牛聚为一类;7 个牦牛群体的期望杂合度均在 0.354 左右,观测杂合度均低于期望杂合度;美仁牦牛连锁不平衡程度较低,甘南牦牛连锁不平衡程度较高;7 个牦牛群体的Fst值均高于 0.04.综上说明,这 7 个牦牛群体间没有过多的基因交流;美仁牦牛在长期的进化过程中形成了一套独特的遗传机制,演变为一个单独的类群.