基于高通量测序的缢蛏三唑磷急性毒性胁迫下miRNA转录组分析

本文通过高通量测序技术分析了三唑磷急性毒性作用下缢蛏miRNA转录组.结果显示,测序数据过滤后的可用序列(clean reads)中长度为21～22 nt的序列占比最高,即大部分序列为微小RNA(miRNA).所有样品中可以比对到参考序列的reads数占比为65.93％～96.96％,其中大部分注释结果为已知及预测的miRNA.无度量多维标定法(non-metric multi-dimensional scaling,NMDS)结果显示,三唑磷试验组中在24 h采集的样品可聚为一组,而其他样品之间无明显的分组.三唑磷处理24 h后缢蛏中共有123组miRNA表达量出现明显差异,其中上调的有122组,下调的1组,上调的miRNA主要分布于miR-184和miR10家族.处理48 h后miRNA表达量无显著差异.处理72 h后有39组miRNA表达量出现显著差异且均为上调,上调的miRNA主要为miR184家族.