番茄斑驳花叶病毒在广东省的首次报道

番茄斑驳花叶病毒(tomato mottle mosaic virus,ToMMV)是2013年发现的烟草花叶病毒属一个新种,目前在多国(地区)有发生.本文采用小RNA深度测序及RT-PCR检测方法在广东省广州市南沙区辣椒疑似病样中检测到ToMMV,命名为番茄斑驳花叶病毒广东分离物(ToMMV-GD-2020).采用RT-PCR分段扩增获得了ToMMV-GD-2020的基因组全序列,该分离物基因组全长6 399 nt,包含4个开放阅读框,分别编码4个蛋白.序列相似性分析表明,ToMMV-GD-2020与已登录GenBank的14个ToMMV分离物基因组序列相似性分别为99.0％～99.7％,其中与中国辽宁分离物ToMMV-LN(GenBank登录号:MN853592)的相似性最高(99.7％),与危害我国番茄、同属烟草花叶病毒属的番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)、番茄褐色皱果病毒(tomato brown ru-gose fruit virus,ToBRFV)代表分离物的相似性分别为84.6％和81.0％.系统进化分析表明,ToMMV-GD-2020与该病毒各分离物亲缘关系均较近,与中国辽宁分离物亲缘关系最近.利用ToMMV的PCR特异引物对广东其他6个市采集的67份辣椒疑似病毒病样品进行检测,结果均为阴性,这说明ToMMV目前还是局部危害广东省辣椒.本文是首次报道在广东发现ToMMV,对监测ToMMV在我国的扩散具有重要意义.