Diversity of ng-mast and mlst sequence types in Russian clinical isolates of Neisseria gonorrhoeae carrying the «mosaic» allele of the penA gene

Molecular Genetics Microbiology and Virology (Russian version)(2022)

引用 0|浏览1
暂无评分
摘要

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Молекулярное типирование современной российской популяции N. gonorrhoeae, направленное на обнаружение эпидемиологически опасных NG-MAST- и MLST-сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA с определяемой этим сниженной чувствительностью к препаратам выбора для терапии гонококковой инфекции — цефалоспоринам III поколения.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

В исследование включены 326 клинических изолятов N. gonorrhoeae, выделенных на территории Российской Федерации в 2018—2020 гг. NG-MAST-типирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов porB и tbpB. MLST-типирование осуществляли на основе анализа нуклеотидных последовательностей семи генов «домашнего хозяйства»: abcZ, adk, aroE, fumC, gdh, pdhC и pgm. Структуру гена penA анализировали секвенированием по Сенгеру.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Молекулярное типирование по протоколам NG-MAST и MLST относило изученные клинические изоляты N. gonorrhoeae к 110 и 41 различным сиквенс-типам соответственно. Секвенирование гена penA выявило «мозаичную» аллель XXXIV типа, кодирующую пенициллин-связывающий белок 2 со сниженной аффинностью к цефалоспоринам, у 7 (2,1%) исследованных клинических изолятов. Сопоставление результатов молекулярного типирования свидетельствовало об обнаружении данного аллеля у сиквенс-типов STNG-MAST2212/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST3149/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST5622/

/STMLST14011 (n=1) и STNG-MAST10025/STMLST1902 (n=4). Филогенетический анализ ассоциировал все названные сиквенс-типы с геногруппой STNG-MAST1407/STMLST1901, представляющей существенную опасность для глобальной системы здравоохранения.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Результаты проведенного исследования демонстрируют дивергенцию сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA, объясняя возникновение подобного разнообразия серией одиночных мутационных событий в генах porB, adk и fumC, учитываемых протоколами NG-MAST- и MLST-типирования.
更多
查看译文
关键词
neisseria gonorrhoeae,russian clinical isolates,mlst sequence types,ng-mast
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要