类风湿关节炎患者与药源性胃黏膜损伤的生物信息学分析
Rheumatism and Arthritis(2023)
Abstract
目的:利用生物信息学分析类风湿关节炎患者与药源性胃黏膜损伤的关系.方法:通过GeneCards、OMIM、TTD、pharmGKB、drugbank数据库检索"rheumatoid arthritis""drug induce gastric mucosal injury",获取类风湿关节炎及药源性胃黏膜损伤2个疾病基因,制作韦恩图获取2个疾病的共同基因,将共同基因导入STRING进行PPI网络分析、GO功能富集及KEGG通路分析.结果:通过检索不同数据库整理去重后,筛选出相关类风湿关节炎基因4953个,药源性胃黏膜损伤相关基因1489个,将2个疾病相关基因取交集后获得共同靶点基因1060个,PPI网络显示TNF、AKT1、GAPDH、CTNNB1、STAT3等为共同关键基因,GO富集主要与线粒体、腺苷受体信号通路、蛋白活性、磷酸酶结合等相关,KEGG信号通路包括NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、Wnt信号通路等.结论:所获得的类风湿关节炎及药源性胃黏膜损伤的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考.
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