基于网络药理学及分子对接技术研究荷丹片治疗代谢综合征的机制

Clinical Journal of Chinese Medicine(2023)

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Abstract
目的:运用网络药理学和分子对接技术探究荷丹片治疗代谢综合征的机制.方法:通过检索TCMSP、Chemistry Database和ETCM数据库,获取荷丹片所含中药的活性成分;通过PubChem、SwissTargetPrediction、SEA和Batman-TCM数据库,获取荷丹片相关作用靶点;通过GeneCards、CTD和DisGeNET疾病数据库获取代谢综合征的靶点.将两者靶点取交集,得到药物-疾病交集靶点,并导入STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析;通过Cytoscape软件构建网络模块及模块功能注释分析,导入Metascape平台进行基因本体论(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后采用AutoDockTools进行分子对接验证.结果:筛选出荷丹片治疗代谢综合征活性成分共129个,共同靶点80个;GO富集分析显示,荷丹片治疗代谢综合征与蛋白质二聚化活动、受体配体活动等分子功能有关,与质膜穴样内陷、分泌颗粒内腔等细胞组成有关,与活性氧代谢过程、有机氮化合物的细胞反应等生物过程相关.KEGG通路主要涉及非酒精性脂肪肝病、在糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End-products-Receptor for Advanced Glycation End Products,AGE-RAGE)信号通路和胰岛素抵抗等 123 条通路.分子对接结果显示,丹参酚醌I等活性成分与人前列腺素内过氧化物合酶 2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)等关键靶点稳定结合.结论:荷丹片中丹参酚醌I、新隐丹参酮Ⅱ、脱氧基新隐丹参酮、硬脂酸、甲基庚烯酮和十四碳烯酸甘油三酯等活性成分主要通过作用于PTGS2、11β-羟类固醇脱氢酶 1 型(11-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase Type 1,HSD11B1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等靶点治疗代谢综合征,与非酒精性脂肪肝病、在糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路和胰岛素抵抗等关键通路有关.
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