宏基因组二代测序在重症肺炎患者病原学中的应用

目的 探究重症肺炎患者肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)与传统培养病原学诊断的差异以及mNGS结果对抗生素方案调整的影响.方法 回顾性分析2019年8月至2021年4月于贵州医科大学附属医院重症医学科住院期间,同时送检BALF传统培养和mNGS的重症肺炎患者.比较两种病原学检测结果的差异,分析mNGS与传统培养诊断的阳性率、一致性及抗生素方案的调整.结果 研究期间共纳入患者75例,其中mNGS的阳性率为97.3％,传统培养阳性率为41.3％;mNGS细菌的检出率为94.7％,传统培养细菌检出率为38.7％;mNGS真菌检出次数最多的为耶氏肺孢子菌24.0％.mNGS对于罕见菌、不典型菌、真菌以及病毒的阳性率远高于传统培养.两组病原学检测结果一致性差(Kappa=0.038,P=0.229),mNGS较传统培养检出更多种类的微生物.基于mNGS检测结果,临床医生对于69％的患者进行抗生素方案的调整.结论 mNGS在重症肺炎患者病原学诊断中敏感性高,对于免疫抑制重症肺炎患者尤为适用.同时,mNGS可以指导临床医师调整抗生素策略.