高通量测序解析烟草苗床期基质细菌和真菌群落结构与多样性变化
Acta Tabacaria Sinica(2023)
Abstract
[背景和目的]烟苗的生长发育状况与育苗基质微生物密切相关,为了解烟苗育苗阶段基质细菌和真菌群落结构与多样性特征.[方法]采用Illumina MiSeq高通量测序对育苗基质中细菌和真菌群落进行测序与分析.[结果]不同育苗阶段基质(播种后第10~66 d)真菌和细菌在菌群结构及相对丰度均存在差异.基质中优势细菌门均为变形菌门Proteobacteria(65.60%~72.80%)、拟杆菌门Bacteroidetes(16.75%~21.35%)和酸杆菌门Acidobacteria(1.38%~4.67%);优势细菌属均为德沃斯氏菌属Devosia(4.81%~14.20%)、罗河杆菌属Rhodanobacter(1.60%~6.19%)、戴氏菌属Dyella(0.38%~8.92%)等,其中,德沃斯氏菌属和罗河杆菌属在播种第66 d的相对丰度较第10 d分别降低8.6%和3.31%.播种第38 d基质细菌Shannon多样性指数和ACE丰富度指数最低,分别为7.25和1161.10;播种第24 d和66 d基质细菌Shannon多样性指数最高,分别为8.15和8.01.基质中优势真菌门均为子囊菌门 Ascomycota(16.84%~23.55%)、担子菌门 Basidiomycota(4.93%~11.95%)和 Aphelidiomycota(0.04%~5.32%);优势真菌属均为假裸囊菌属 Pseudogymnoascus(0.42%~11.63%)、节丛孢属 Arthrobotrys(0.28%~14.29%)、革菌属 Tomentella(0.21%~8.96%)等,其中,节丛孢属和革菌属在播种第52d的相对丰度较第10d分别提高14.01%和8.57%.播种第24d基质真菌Shannon多样性指数最低,为3.93;播种第10 d和52 d基质真菌Shannon多样性指数最高,分别为5.57和5.86.功能预测显示,播种66 d内烟苗基质细菌主要功能分布在代谢类、遗传信息处理类和环境信息处理类等;真菌主要功能分布在腐生类和外生菌根类.[结论]烟草苗床期基质细菌和真菌群落种类无显著变化,但其相对丰度与多样性指数在不同育苗阶段存在差异.
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Key words
seedling stage,nursery substrate,Illumina MiSeq high-throughput sequencing,community structure,tobacco seedling,microbial diversity
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