高通量测序解析烟草苗床期基质细菌和真菌群落结构与多样性变化

[背景和目的]烟苗的生长发育状况与育苗基质微生物密切相关,为了解烟苗育苗阶段基质细菌和真菌群落结构与多样性特征.[方法]采用Illumina MiSeq高通量测序对育苗基质中细菌和真菌群落进行测序与分析.[结果]不同育苗阶段基质(播种后第10～66 d)真菌和细菌在菌群结构及相对丰度均存在差异.基质中优势细菌门均为变形菌门Proteobacteria(65.60％～72.80％)、拟杆菌门Bacteroidetes(16.75％～21.35％)和酸杆菌门Acidobacteria(1.38％～4.67％);优势细菌属均为德沃斯氏菌属Devosia(4.81％～14.20％)、罗河杆菌属Rhodanobacter(1.60％～6.19％)、戴氏菌属Dyella(0.38％～8.92％)等,其中,德沃斯氏菌属和罗河杆菌属在播种第66 d的相对丰度较第10 d分别降低8.6％和3.31％.播种第38 d基质细菌Shannon多样性指数和ACE丰富度指数最低,分别为7.25和1161.10;播种第24 d和66 d基质细菌Shannon多样性指数最高,分别为8.15和8.01.基质中优势真菌门均为子囊菌门 Ascomycota(16.84％～23.55％)、担子菌门 Basidiomycota(4.93％～11.95％)和 Aphelidiomycota(0.04％～5.32％);优势真菌属均为假裸囊菌属 Pseudogymnoascus(0.42％～11.63％)、节丛孢属 Arthrobotrys(0.28％～14.29％)、革菌属 Tomentella(0.21％～8.96％)等,其中,节丛孢属和革菌属在播种第52d的相对丰度较第10d分别提高14.01％和8.57％.播种第24d基质真菌Shannon多样性指数最低,为3.93;播种第10 d和52 d基质真菌Shannon多样性指数最高,分别为5.57和5.86.功能预测显示,播种66 d内烟苗基质细菌主要功能分布在代谢类、遗传信息处理类和环境信息处理类等;真菌主要功能分布在腐生类和外生菌根类.[结论]烟草苗床期基质细菌和真菌群落种类无显著变化,但其相对丰度与多样性指数在不同育苗阶段存在差异.