人乳头状瘤病毒感染与喉咽鳞状细胞癌相关性的Meta分析及生物信息学分析

目的 系统评价人乳头状瘤病毒(HPV)感染与喉咽鳞状细胞癌的相关性并探索该疾病预后的潜在指标.方法 计算机检索PubMed、Embase、The Cochrane Library、中国知网、中国生物医学文献数据库、维普和万方数据库,检索时限均从建库至2020-11-30.由2位评价员独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用Stata15.1及RevMan 5.3软件进行Meta分析.从GEO数据库获取HPV相关头颈癌的芯片数据进行差异基因分析,并对这些基因进行功能注释.利用GEPIA数据库得到生存相关的关键基因.结果 共纳入11篇文献,包含喉咽鳞状细胞癌患者1245例,合并后HPV总阳性率为12％(95％CI:6％～19％).亚组分析结果,国内喉咽鳞状细胞癌患者HPV阳性率为19％(95％CI:12％～26％),较国外患者HPV阳性率为10％(95％CI:2％～18％)高(P＜0.05);不同检测技术,聚合酶链式反应(PCR)+原位杂交(ISH)的HPV阳性率为18％,较单纯ISH及PCR检测HPV阳性率高(P＜0.05);男女喉咽鳞状细胞癌患者HPV阳性率无明显差异(P＞0.05);合并预后HR=0.33(95％CI:0.14～0.79)(P＜0.05).对HPV阴性及阳性的头颈癌患者差异基因进行GO和KEGG富集分析表明,这些差异基因与多种重要通路有关.GEPIA对Top10显著差异基因进行生存分析得到关键基因ZNF541、WNK3、TCP11及CCNA1.结论 国内喉咽鳞状细胞癌患者HPV阳性率高于国外,PCR+ISH组的HPV阳性率较PCR与ISH组阳性率高,HPV阳性患者预后好于HPV阴性患者.生存相关基因可与HPV共同参与头颈癌的预后评价并提供新的研究思路.