贵州地区人类埃可病毒14型的VP1基因特征分析

Chinese Journal of Viral Diseases(2022)

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摘要
目的 分析贵州地区人类埃可病毒14型(Echovirus 14,ECHO 14)分离株的VP1基因特征,为ECHO 14的防控提供科学依据.方法 收集2001-2021年贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统中从AFP病例及健康儿童粪便标本中分离到的15株ECHO 14毒株并进行回顾性鉴定分析,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1基因并对扩增产物测序,用MEGA7.0构建系统进化树并对氨基酸位点突变进行分析.结果 贵州地区15株ECHO 14分离株属于A、B和C基因亚型,其中A基因亚型占比达80.0%(12/15).15株ECHO 14分离株之间的核苷酸一致性为81.8%~97.1%,氨基酸同源性为94.3%~99.7%,与原型株Tow(Rhode Island/54)株之间的核苷酸一致性为77.1%~79.4%,氨基酸同源性为95.1%~98.4%;与ECHO 14原型株Tow株比较分析,结果显示在VP1氨基酸序列上存在33个突变位点,其中8个位点已完全突变分别为N8D、K132T、G157D、L217M、V2371、M295L、H296Q和H298R.结论 2000-2021年贵州省AFP病例中分离的ECHO 14毒株属于A、B和C基因亚型,VP1区的氨基酸多位点变异,可能导致了多条传播链在贵州地区共循环,其中A基因亚型是2006年后贵州地区传播的优势亚型.
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