基于转录组学分析双氢青蒿素干预肝癌细胞HepG2215后的基因表达差异

目的 基于转录组学探讨双氢青蒿素(DHA)干预肝癌细胞HepG2215后的基因表达差异.方法 将HepG2215细胞分为DHA组和对照组,DHA组以22.5μmol·L-1 DHA干预24 h,对照组以含有0.1％DMSO的培养基进行干预.提取各组肝癌细胞的总RNA,利用Illumina平台测序获得2组HepG2215细胞间的差异表达基因[DEG,|log2FC|＞1且错误发现率(FDR)＜0.05],并通过qRT-PCR实验验证转录组测序数据的可靠性.通过GO功能及KEGG通路富集分析、蛋白互作(PPI)网络分析对DEG进行功能预测和分析.结果 与对照组相比,DHA组HepG2215细胞鉴定出238个DEG,其中上调基因73个,下调基因165个.qRT-PCR实验结果表明,与对照组相比,DHA组细胞AKR1C1 mRNA表达显著上调(P＜0.01),而PLA2G2A、PGC mRNA表达显著下调(P＜0.01),与转录组测序结果一致.在细胞组分中,与细胞外区域相关富集的基因较多;在生物过程中,与受体、配体活性调节相关富集的基因较多;在分子功能中,与对细菌的反应、对金属离子的反应、免疫和炎症反应及氨基糖苷类抗原代谢富集的相关基因较多.显著富集的前3条KEGG信号通路为矿物质吸收通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、NF-κB信号通路.TNF-α诱导蛋白3(TNFAIP3)、杆状病毒IAP重复序列3(BIRC3)、核苷酸结合寡聚化结构域蛋白2(NOD2)可能是DHA干预HepG2215细胞的关键核心靶点.结论 DHA可能作用于TNFAIP3、BIRC3、NOD2等靶点基因,通过金属硫蛋白(MT)家族、IL-17及NF-κB信号通路,影响肝癌细胞的金属稳态、NK细胞介导的肿瘤杀伤效应和炎症反应,发挥对HepG2215细胞的干预作用.