大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征

目的 分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征.方法 采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型.结果 从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15％-100％、98.13％-100％,属于Ⅰ A基因亚型.获得序列与中国大陆序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42％-99.69％;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07％-100％.在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100％,1条序列与其存在2个氨基酸差异.结论 大连市2020年HAV优势流行株为Ⅰ A基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源.HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施.