防气溶胶污染的UDG-LAMP-LFD核酸检测体系的建立
Journal of Parasitic Biology(2023)
Abstract
目的 建立一种基于热敏UDG酶防污染的、环介导等温扩增(LAMP)技术及横向流动试纸条(LFD)联合使用的核酸检测方法,实现对HPV18的快速、可视化检测.方法 使用LAMP在线引物设计软件设计HPV18特异性引物,同时引入热敏UDG酶,建立UDG-LAMP检测体系,优化T/U碱基比例,设置对照试验验证热敏UDG酶防污染能力;根据LFD要求,设计特异性同化探针及淬灭探针,建立UDG-LAMP-LFD核酸检测体系并对LAMP反应时间进行优化;对该体系进行灵敏度、特异性及临床样品的验证,并与QPCR结果进行比较.结果 优化的LAMP反应时间为40 min,T/U比例为1∶1;热敏UDG酶孵育时间为10 min,防污染效果显著;LFD结果判读耗时5 min,整个检测时间为55 min.该UDG-LAMP-LFD核酸检测体系在以HPV18作为检测对象时,灵敏度103拷贝/μl;29例临床样品的验证结果与QPCR检测结果完全一致.结论 建立的UDG-LAMP-LFD检测体系可快速、特异、灵敏、可视化的检测HPV18,同时可避免气溶胶污染导致的假阳性.该方法对实验设备及工作人员要求较低,适合在偏远地区及基层医院使用.
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