腺病毒55型感染致急性结膜炎病例的病原学鉴定及全基因序列分析

LIU Jiajing,CUI Xiaoqing, ZHANG Wanju,FANG Fanghao, PENG Yajun,CHEN Min, ZHANG Jingyi,TENG Zheng

Shanghai Journal of Preventive Medicine(2023)

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摘要
[目的]了解2021年上海市B亚属人腺病毒分离株的基因特征.[方法]对1例腺病毒55型感染导致的急性结膜炎病例进行病原体分离鉴定及全基因组测序,分析主要抗原蛋白六邻体(Hexon)、五邻体(Penton)、纤维突蛋白(Fiber)基因及全基因组序列的进化特征.[结果]该病毒株属于B亚属B2亚组,Hexon基因与HAdV-11进化关系相近,而Fiber和Penton基因则与HAdV-14进化关系更为接近.核苷酸序列比对分析显示,该病毒与近期国内外流行的HAdV-55病毒株同源性均超过99.90%,与广东株73-GD_CHN_2016核苷酸相似度最高,在E1B、L4、E3和L5基因区存在氨基酸变异.[结论]上海株(MH2021001)为腺病毒B亚属55型,该病毒基因组未发生多基因片段重组,与国内流行病毒株相比存在部分氨基酸变异,其生物学特性有待进一步研究.
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关键词
human adenovirus-55,acute hemorrhagic conjunctivitis,complete genome sequencing,genomic characteristics
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