番茄品质性状的表型变异和关联作图

果实品质一直都是番茄遗传育种研究领域的热点.为了挖掘新的相关QTLs,本研究以191份栽培番茄为试材,包括24份樱桃番茄、108份常规品种和59份现代品系,对番茄单果重、果实横径、果实形状、心室数、糖含量和硬度6个品质性状进行两个年份的表型分析.结果显示所有性状均表现出丰富的表型变异,其中单果重、果实横径、果实形状和心室数在三个群体间均差异显著.选取273个分子标记(120个SNP,128个InDel和25个SSR)对所有试材进行基因分型,群体结构分析显示所有试材可分为3个亚群体,与预先划分的3个群体基本一致.利用基于全基因组扫描的策略对6个性状进行关联作图,共获得与目标性状相关联的分子标记33个,与硬度相关联的标记最多(8),与果实横径关联的标记最少(3).总共有17个关联标记(51.5％)与前人报道的QTLs/基因位于相同的位置.本研究结果可以与前人发现的相关QTLs相互验证,同时也检测到一些新的影响番茄品质的QTL位点.