光皮树SNP高密度遗传图谱构建

本研究采用F1代群体简化基因组测序(RAD-seq)技术,构建了光皮树亲本的遗传图谱.统计结果显示,SNP基因分型共57089个,校正后为57071个,基因型为hk×hk、nn×np和lm×ll.过滤与筛选后统计占比,hk×hk为28.59％,nn×np为14.52％,lm×ll为12.92％.通过对F1代进行连锁遗传图谱标记,9个连锁群综合遗传距离从93.26到241.02 cM不等,综合覆盖图距为1260.94 cM,平均每个连锁群1091个标记,标记数最大的连锁群是Lg1,标记数为1744个;标记数最小的连锁群是Lg9,只有579个.通过对SNP标记数、标记距离和覆盖图距3个参数指标进行相关性分析,SNP标记数与覆盖图距呈极显著正相关,相关系数0.907.本研究构建了光皮树高密度遗传图谱,为其农艺性状定位与基因挖掘奠定了良好的基础.