伪狂犬病病毒贵州分离株与疫苗株遗传进化和抗原表位分析

[目的]了解贵州省猪群伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株与疫苗株的分子特征,探究贵州省PRV变异株的遗传演化情况并对比其与疫苗株抗原差异性.[方法]通过分子克隆和生物信息学技术对本实验室在2015-2021年间贵州省分离到的5株PRV毒株的gB、gC、gD基因和商品化疫苗株(C株和HB2000株)进行克隆测序,利用本实验室序列库中的2株PRV贵州株及GenBank上登录的疫苗毒株序列,进行系统遗传进化和B细胞线性抗原表位差异性分析.[结果]结果显示,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的核苷酸序列相似性分别为98.1％～100％、94.7％～100％和98.8％～100％,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的氨基酸序列相似性分别为96.4％～100％、90.9％～100％和97.0％～100％;氨基酸替换分析结果显示,7株PRV贵州株和疫苗毒株间gB、gC、gD基因存在56、68和23处氨基酸位点差异,其中gC基因氨基酸位点差异最大;GZQX2017株缺失gE基因,在遗传进化树中GZQX2017株与Bartha-K61、Becker和NIA3等国外株位于同一大进化分支,属于PRV Ⅰ型;其余6株贵州株gE基因在第48和496位各插入1个天冬氨酸(D),符合流行变异株的基因特征,与国内流行PRV变异株位于另一大进化分支,属于PRV Ⅱ型;以GZQX2017株gB、gC、gD全基因作为目标基因,以Bartha-K61株作为主要亲本、Fa株作为次要亲本,gB、gC全基因均能检测到重组信号,gD全基因重组信号不明显;相比Bartha-K61株,gB、gC、gD蛋白抗原表位数量和位点存在差异.[结论]7株PRV贵州株中,GZQX2017株与疫苗Bartha-K61株、C株属于PRV Ⅰ型,GZQX2017株可能是由Bartha-K61株为主要亲本进行重组产生的gE基因自然缺失株,后续有望将其作为候选疫苗株进行进一步研究;其余6株贵州株与Fa株、HB2000株等属于PRV Ⅱ型,具有流行变异毒株的流行特征.本研究结果对了解中国贵州省流行PRV毒株分子特征具有十分重要的意义.