基于生信分析探索PNPT1表达对非小细胞肺癌的影响

目的 探讨PNPT1的表达对非小细胞肺癌及肿瘤微环境的影响.方法 基于TCGA数据集中的肺腺癌和肺鳞癌相关数据以及GTEx数据集中的健康人相关数据,使用GEPIA2数据库挖掘PNPT1在非小细胞肺癌组织与正常组织的表达差异,并通过绘制生存分析评估PNPT1表达量对非小细胞肺癌患者预后的影响.使用TIMER2.0数据库基于CIBERSORT算法进行PNPT1表达与免疫细胞浸润水平相关性预测,并使用GEPIA2数据库分析肿瘤组织中PNPT1与炎症和肿瘤杀伤相关因子编码基因的关联,以评价PNPT1表达水平对肿瘤微环境的影响.结果 在非小细胞肺癌肿瘤组织中PNPT1表达增加(肺鳞癌:log2 FC=0.976,P<0.01;肺腺癌:log2FC=0.331,P<0.01),且在不同分期间差异有统计学意义(F=3.17,P<0.05).免疫细胞浸润相关性分析结果显示,PNPT1表达水平与非小细胞癌M1型巨噬细胞水平成正相关(肺腺癌:R=0.232,P<0.01;肺鳞癌:R=0.118,P<0.01),在肺腺癌组织中发现PNPT1与STAT1以及白细胞介素(IL)-6、CXCL8和IL-12A等炎症因子的编码基因呈正相关(R>0,P<0.05),同时与肿瘤杀伤因子IFNG(R=0.13,P<0.01)以及GZMB(R=0.16,P<0.01)间存在正相关.结论 PNPT1在非小细胞肺癌中表达升高,PNPT1表达水平与非小细胞肺癌肿瘤免疫具有一定关联.