K562细胞中N-乙酰基转移酶10的RNA结合图谱分析

目的 对N-乙酰基转移酶10(NAT10)在人慢性髓原白血病细胞系K562中的RNA结合图谱进行描绘.方法 利用紫外交联免疫沉淀技术(eCLIP)捕获NAT10在K562细胞中结合的转录本集合,对其进行高通量测序,并对数据进行生物信息学分析.通过peak-calling分析和对peaks进行注释,鉴定NAT10结合位点.并对所结合基因的类型和结合区域进行分析.进一步通过基因功能富集分析,探索其结合的RNA的功能.结果 NAT10主要结合于蛋白质编码基因的转录本,并在3′非翻译区域(3′UTR)富集,预测显示其结合的转录本与DNA损伤修复等功能相关.结论 NAT10可能通过与DNA损伤修复相关信使RNA(mRNA)的3′UTR区域结合,实现基因表达调控作用.