乳腺癌中COL17A1表达的意义及其免疫相关性

Journal of China Medical University(2023)

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Abstract
目的 基于生物信息学分析乳腺癌中COL17A1表达的意义及其免疫相关性.方法 利用各种数据库分析COL17A1在乳腺癌中的表达情况、差异表达基因、基因本体论 (GO) 功能注释和京都基因和基因组数据库 (KEGG) 通路富集分析、与淋巴细胞浸润和趋化因子相关性以及患者生存预后分析.Western blotting和实时定量PCR (qRT-PCR) 检测乳腺癌细胞中COL17A1的表达.结果 与正常乳腺组织比较,COL17A1在乳腺癌不同状态 (肿瘤分期,年龄,绝经前、中、后和淋巴结转移等) 均表达降低 (均P < 0.05); 并且COL17A1低表达与患者低生存率相关.COL17A1差异表达基因的GO功能分析结果显示主要富集在表皮发育与形成、细胞-细胞间连接和钙离子结合等; KEGG通路富集分析显示主要富集在PI3K-AKT信号通路.Western blotting和qRT-PCR检测结果显示,与MCF-10A细胞比较,不同乳腺癌细胞中COL17A1的表达均显著降低 (均P < 0.0001).乳腺癌组织中COL17A1与CCL14、CCL21、CX3CL1和CCL19等趋化因子和CCR6、CX3CR1等趋化因子受体水平相关 (均P < 0.001); COL17A1与Th17细胞、活化B细胞和肥大细胞等免疫淋巴细胞浸润相关 (均P < 0.001).结论 乳腺癌组织和细胞中COL17A1呈低表达;COL17A1低表达与患者不良预后显著相关.COL17A1可作为乳腺癌免疫治疗的潜在靶点.
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breast cancer,COL17A1,bioinformatics
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