普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析

Bulletin of Botany(2023)

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摘要
普通菜豆镰抱菌枯萎病是严重制约菜豆(Phaseolusvulgaris)产量的主要病害之一.采用下胚轴双孔注射法对601份普通菜豆种质资源进行枯萎病抗性鉴定,共筛选出4份高抗材料.在此基础上,基于分布在全基因组上的3 765 456个单核苷酸多态性(SNP)标记,进行全基因组关联分析,以P<1×10-5为阈值.结果检测到57个显著关联的SNP位点,分布于1、2、6、8和11号染色体上;共获得8个显著关联区域,其中位于1号染色体上的区域1包含SNP最多(48个),最显著SNPP值为2.18E-07.在8个显著关联区域中,共检测到186个基因,其中157个基因有注释信息,编码过氧化物酶、抗病蛋白、转录因子和蛋白激酶等.结合KEGG富集分析和序列同源性比对,鉴定出9个候选基因可能与抗性相关.
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关键词
common bean,fusarium wilt,genome-wide association study,resistance gene/germplasm resources
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