基于生物信息学探讨miRNA在糖尿病合并冠心病患者中的意义

目的 基于生物信息学探讨影响2型糖尿病(T2DM)合并冠状动脉心脏病(CHD)的潜在机制,通过筛选T2DM合并与不合并CHD患者中差异miRNA,观察差异miRNA在T2DM合并CHD中的作用及临床价值.方法 选取GEO数据库中GSE185845数据集并经GEO2R在线平台筛选差异miRNA,并经Tar-getScanHuman网站预测调控的基因,绘制火山图、PPI图和KEGG富集图并进行相应的分析.结果 从GSE185845数据集中筛选出2个差异miRNA,分别为miR-4465和miR-6089,相关分析提示miR-4465和miR-6089呈正相关(r=0.577,P＜0.01).PPI图显示与差异miRNA共有的基因有2个,为SNN和GMFB,主要富集于MAPK靶点相关的信号通路、FCGR3A调控的磷酸化、固有免疫系统等.生物过程主要富集于Arp2/3复合物调控的肌动蛋白核酸、同源修复基因缺陷等;分子功能主要富集于肌动蛋白结合、NO的激活、细胞色素B5还原酶的激活等;细胞组分主要富集于肌动蛋白细胞骨架,Arp2/3蛋白复合物和细胞与细胞的交联等.结论 miR-4465和miR-6089可能是导致T2DM并发CHD的潜在靶miRNA,这可能与其调控的SNN和GMFB表达有关,机制可能涉及到MAPK靶点相关的信号通路.