南京地区成人上呼吸道感染患者鼻病毒分子流行病学特征分析

Chinese Journal of Microbiology and Immunology(2023)

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Abstract
目的:分析南京地区成人上呼吸道感染(upper respiratory tract infection,URTI)患者人鼻病毒(human rhinovirus, HRV)的感染特征及流行特征。方法:收集2021年10月—2022年9月南京地区成人上呼吸道感染患者的流行病学资料,采集临床标本使用荧光定量逆转录聚合酶链反应开展14种常见呼吸道病毒的检测;对HRV阳性标本VP4/VP2编码区基因扩增测序并做进化分析。结果:共收集399份上呼吸道感染患者的咽拭子样本,呼吸道病毒的总体阳性检出率为28.07%(112/399),其中HRV的检出率最高,达到9.52%(38/399);38株HRV阳性标本中37株成功测序,共鉴定为3种基因型,分别为13株HRV-A、14株HRV-B、10株HRV-C,涉及25种血清型;其中3种HRV的基因型呈现交替流行或共流行。结论:HRV是2021年10月—2022年9月南京地区成人上呼吸道感染者的主要病原体,且HRV-A、B、C三种基因型共流行或交替流行。
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Human rhinovirus,Upper respiratory tract infection,Phylogenetic tree
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