高通量测序技术分析化疗对食管癌患者肠道菌群的影响及其与化疗效果的关系

China Medicine(2023)

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Abstract
目的 探讨化疗对食管癌患者肠道菌群的影响及其与化疗效果的关系.方法 选取2021年11月至2022年3月河南省南阳市中心医院收治的食管癌患者12例.收集其化疗前及化疗2个周期后的粪便样本,采用16S rRNA高通量测序技术分析粪便样本中的微生物多样性和组成差异,以及不同化疗效果组之间的菌群差异.结果 在门水平上,化疗前后食管癌的肠道菌群均主要由厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门和变形菌门组成,占总群落的96.0%以上.化疗后粪便样本中表征肠道菌群丰富度的Chao1指数和Observed-species指数以及表征肠道菌群多样性的Shannon指数和Simpson指数均明显高于化疗前样本[(1916±1260)比(1005±302)、(1672±1073)比(869±279)、(7.0±1.3)比(5.9±0.7)、(0.96±0.03)比(0.93±0.06)],差异均有统计学意义(均P<0.05).Beta多样性分析结果显示化疗后与化疗前的粪便样本中的菌群结构差异有统计学意义,组间差异大于组内差异(R=0.089,P=0.049).线性判别分析效应大小分析显示,肠道菌群厚壁菌门、梭杆菌科等在临床获益组患者中明显减少(P<0.05),乳酸杆菌属、罗氏菌属在临床获益组患者中则明显增加(P<0.05).结论 食管癌患者化疗前后肠道微生物群落结构存在明显差异,临床获益患者的肠道微生物群中以罗氏菌属、乳酸杆菌为主的产短链脂肪酸菌属明显增多.
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Esophageal cancer,Intestinal flora,Chemotherapy effect,High-throughput sequencing
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