5-azaC对'巨峰'葡萄果实发育阶段mRNA可变剪接的影响

DNA甲基化和mRNA可变剪接在果实发育过程中均发挥重要作用,但两者间的联系和互作关系尚不清楚.基于5-氮杂胞苷(5-azaC,DNA甲基转移酶抑制剂)处理可以使'巨峰'葡萄成熟期提前,对5-azaC处理后的'巨峰'RNA-seq测序,分析果实不同发育阶段发生的可变剪接事件.结果表明,3'端可变剪切位点(A3)类型在处理和对照中均最多,外显子互斥(MX)类型最少.可变剪接在不同发育阶段存在特异调节,发育前期可变剪接的调控更为频繁;鉴定到9 683个发育过程中保守的可变剪接事件.在处理与对照间有671个可变剪接事件存在明显的剪接变化,功能注释显示其中有14个基因与甲基化修饰相关,表明可变剪接与甲基化修饰协同调控葡萄果实成熟过程.