苹果NCL家族基因与根系细胞钙离子浓度变化的关系

Acta Horticulturae Sinica(2023)

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Abstract
基于拟南芥类Na+/Ca2+交换蛋白(NCX-Like,NCL)序列以及苹果、葡萄、草莓、桃和梨全基因组信息,分析了 NCL家族特征、苹果MdNCL表达以及不同处理下湖北海棠根系MhNCL的表达水平与细胞Ca2+浓度变化的关系.结果表明,NCL家族成员在进化中高度保守,苹果基因组中的4个MdNCL的启动子上均含有胁迫响应及激素应答相关的顺式作用元件,且在苹果各器官均有不同程度表达.依据MdNCL保守结构域,从湖北海棠中确定4个相应的MhNCL基因(MhNCL-1、MhNCL-2、MhNCL-3和MhNCL-4),其中MhNCL-1、MhNCL-3和MhNCL-4的表达水平在NaCl和CaCl2处理下基本呈现"变化不大—上升—下降"的规律,在ABA和IAA处理下表现出"变化不大—上升—下降—上升"的特征.根系细胞Ca2+浓度在NaCl和CaCl2处理下呈现"升高—降低—小幅度升高"的规律,在ABA和IAA处理下呈现"升高—降低—升高—降低"的趋势,初步表明根系MhNCL的表达水平与根系Ca2+浓度变化存在一定相关性.
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apple,NCL gene,genome-wide identification,Ca,2+,concentration
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