向日葵抗旱自交系叶片转录组SNP位点信息挖掘

为探究响应向日葵干旱胁迫的转录组SNP标记信息,以向日葵抗旱自交系17062为供试材料,利用RNA-seq技术结合生物信息学分析方法,对SNP标记进行统计分析.结果表明,SNP类型分析中,转换率占62.82％,颠换率占37.17％,转换中以C/T发生频率最高,为31.51％.功能原件分布中,分布在外显子区的SNP数量为178744.3个,显著多于其他功能元件.对SNP位点序列注释发现,有76678条SNP基因具有GO注释,4379条具有KEGG注释.筛选GO注释排序前30位(Top30)差异基因(DEGs)中重复存在的SNP基因序列,得到1542条,其中650条基因序列有GO注释.这些差异基因涉及到了多个生物功能与重要代谢途径,对向日葵转录组SNP标记开发、向日葵抗旱种质资源鉴定及抗旱"三系"杂交种选育具有重要意义.