基于网络药理学和分子对接探讨上中下通用痛风方治疗痛风性关节炎的分子机制

Special Wild Economic Animal and Plant Research(2023)

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摘要
本文探讨上中下通用痛风方治疗痛风性关节炎(GA)的潜在分子机制.检索中药系统药理学分析平台,挖掘上中下通用痛风方的活性成分和对应靶点,检索DisGeNET、GeneCards和DrugBank等数据库,挖掘GA疾病靶点,采用R语言Venn包,获取药物与GA的交集靶点基因.采用Cytoscape 3.8.0构建药物-成分-靶点网络并筛选核心成分;采用String平台构建交集靶点的蛋白互作网络并筛选核心靶点基因.采用R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析,采用AutoDock Vina软件进行分子对接.共挖掘出上中下通用痛风方与GA交集靶点基因45个.筛选出槲皮素、黄芩素和汉黄芩素等7种核心成分,重组人趋化因子8(CXCL8)、白介素(IL)-1β等3种核心靶点基因.GO功能共富集1 561个条目,主要涉及对脂多糖的反应、细胞膜凹样内陷和氧化还原酶活性等;KEGG通路共富集120个条目,如AGE-RAGE、IL-17等.分子对接结果表明,核心成分与靶点蛋白结合活性良好.上中下通用痛风方核心成分棚皮素、黄芩素和汉黄芩素等可通过作用于CXCL8、IL-1β等核心靶点对AGE-RAGE和IL-17等信号通路进行调控,从而发挥治疗GA的作用.
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关键词
network pharmacology,molecular docking,upper and middle and lower gout formula,gout arthritis
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