不同部位骨骼预处理及DNA提取方法的比较研究

目的 比较不同部位骨骼预处理及脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)提取方法,以期确定骨骼DNA最优提取流程.方法 先收集一头家养牛的新鲜骨样本,包括股骨、肱骨和肋骨各一根,采用球磨法和冷冻研磨法制备骨粉,利用AutoMate ExpressTM磁珠法等5种方法提取DNA,并运用配对t检验和单因素方差分析比较不同提取方法下DNA质量浓度、纯度和短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型结果.结果 在产量方面,球磨法具有较大优势,利用AutoMate ExpressTM磁珠法提取的DNA质量浓度最高;在纯度方面,2种预处理方法无显著性差异,AutoMate ExpressTM磁珠法提取的DNA纯度最高;在STR检测方面,冷冻研磨法结合AutoMate ExpressTM磁珠法可获得较好的STR分型结果及基因座检出率.此外,肋骨更可能获得最佳DNA产量和STR检测结果.结论 冷冻研磨法是一种更为理想的骨骼预处理方法,在此基础上结合AutoMate ExpressTM磁珠法可极大提高骨骼DNA回收率.此外,肋骨更适用于骨骼DNA鉴定实践.